A Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação tem estrutura de funcionamento estabelecida com Pró-Reitoria, Secretaria, Comissão de Pesquisa e Comissão de Pós-Graduação. A Pró-Reitoria será ocupada por professor doutor, com experiência em ensino, inovação e pesquisa. A Secretária será de responsabilidade de um colaborador graduado, com experiência em secretaria de ensino superior. A Comissão de Pesquisa será composta pelos Coordenadores de Cursos e Gestores de Pesquisa de cada Curso de Graduação e Pós-Graduação, presencial ou EaD. A Comissão de Pós-Graduação Stricto Sensu será composta por todos os Coordenadores de Cursos de Pós-Graduação Stricto Sensu. Na estrutura para pesquisa e sua difusão os órgãos de apoio são: Programa de Iniciação Científica, NUBEM, Revista Formar Interdisciplinar, Biotério, Comissão de Biossegurança, CEP, CEUA, NIT, Coordenação Grupos de Pesquisa no CNPq e Diretoria de Pós-Graduação Lato Sensu.